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固定效应模型和随机效应模型之间最大的区别就在于其基本假设，即个体不随时间改变的变量是否与所预测的或自变量有关。固定效应更适合研究样本之间的区别，而随机效应适合由样本来推断整体特点。
固定效应模型觉得包括个体影响功效的变量是内生的，而与此相反随机效应模型是假定所有的包括个体随机影响的回归变量是外生。
固定效应模型默认了那些不随时间变化而变化的自变量不会对因变量产生影响，因此不可以这种变量出现在模型当中；随机效应模型则认为表明某些个体特点的但不随时间变化而变化的自变量可以对因变量产生影响，允许这种变量引入到模型当中。
随机效应之间的方差相关性为负。其实这也不难理解，毕竟总方差是固定的，某个随机效应解释的变异多一些，相对性的另一个随机效应解释的变异就少一些。
这些做法我们都称其为固定效应(Fixedeffect)的比较方法，因为这里面被试是一个固定效应而非随机效应，不同被试的最优模型是服从同一个分布，而非不同的分布的。关于固定效应和随机效应的具体定义和关系，可以参见包寒吴爽大神的文章：差之毫厘，谬以千里：辨析「固定效应、主效应、简单效应。
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